动态
PlantVirusDetect v2.1 发布 -- 更新交互界面，添加序列查询功能 [2020-11-05]
PlantVirusDetect v2.0 发布 -- 更新交互界面，同时修复多个已知问题 [2020-11-01]
PlantVirusDetect v1.4 发布 -- 修复多个已知问题 [2020-10-10]
PlantVirusDetect v1.3 发布 -- 修复多个已知问题 [2020-09-22]
更新数据库 -- 添加了多条参考序列 [2020-09-10]
PlantVirusDetect v1.2 发布 -- 修复多个已知问题 [2020-09-08]
PlantVirusDetect v1.1 发布 -- 添加 BLASTn 算法，完成算法对接和测试 [2020-08-20]
PlantVirusDetect v1.0 发布 -- 植物病毒参考序列总库发布. [2020-08-08]
园艺植物病毒检测和鉴定研究
植物病原病毒是仅次于真菌的重要病原物。据1999年统计，有900余种病毒可引起植物病害。很多园艺植物病毒病对生产造成极大的危胁。随着我国农业种植结构的调整，园艺作物在我国国民经济中的地位和比重逐年上升。然而园艺作物多为无性繁殖，易感染病毒，且一旦被感染则终生带毒，其持续累积导致园艺作物产量逐年下降和品质变劣，严重时造成植株快速衰退或死亡，甚至毁园(圃)，严重损害园艺作物产业的持续发展。繁育和使用无病毒种苗（球）是防控园艺作物病毒病害的最有效措施。因此，加强病毒检测和无病毒种苗（球）繁育技术的研发，对园艺作物的高效栽培和提质增效具有重要的促进作用。基因测序技术在病毒检测中起到重要作用。
第一代DNA测序技术用的是1975年由桑格（Sanger）和考尔森（Coulson）开创的链终止法或者是1976-1977年由马克西姆（Maxam）和吉尔伯特（Gilbert）发明的化学法（链降解）。并在1977年，桑格测定了第一个基因组序列，是噬菌体X174的，全长5375个碱基1。自此，人类获得了窥探生命遗传差异本质的能力，并以此为开端步入基因组学时代。研究人员在Sanger法的多年实践之中不断对其进行改进。在2001年，完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的Sanger法为其测序基础。至今，第一代DNA测序技术仍然是精确有效的园艺作物病毒病检测技术。本网站针对第一代DNA测序技术，提供测序文件的自动化和批量化在线分析。
第二代测序（Next generation sequencing, NGS）技术是近年来快速发展的不依赖于已知序列信息的核苷酸测定技术。自2009年Adams等人应用NGS 和宏基因组技术测定了侵染番茄的凤果花叶病毒以来，该技术已成为新病毒鉴定的主要途径。我们从2016年以来采用NGS 技术测定了园艺植物的宏基因组及小干扰性RNA，先后从梨、桃、猕猴桃、葡萄和野玫瑰样品中鉴定出病毒和类病毒近50 种，鉴定并命名新病毒近10 个。NGS 技术的应用需要采用多种软件分析，包括去接头、拼接、比对和分析软件。本网站基于第二代测序技术，针对园艺作物病毒提供二代测序文件的园艺作物病毒在线分析。